Abstract DNA barcoding helps to identify species, especially when identification is based on parts of organisms or life stages such as seeds, pollen, wood, roots or juveniles. However, the implementation of this approach strongly depends on the existence of complete reference libraries of DNA sequences. If such a library is incomplete, DNA-based identification will be inefficient. Here, we assess if DNA barcoding can already be implemented in species-rich tropical regions. We focus on the tree flora of São Paulo state, Brazil, which contains more than 2000 tree species. Using new DNA sequence data and carefully assembled GenBank accessions, we assembled 12,113 sequences from ten different regions. The ITS, rbcL, psbA-trnH, matK and trnL regions were better represented within the available sequences for São Paulo tree flora. Currently, only 58% of the São Paulo tree flora currently have at least one barcoding sequence available. However, these species represent on average 89% of the trees in São Paulo state forests. Therefore, conservation-oriented and ecological studies can already benefit from DNA barcoding to obtain more accurate species identifications. We present which taxa remain underrepresented for the São Paulo tree flora and discuss the implications of this result for other species-rich tropical regions.

Na floresta Ombrófila Densa do Parque Estadual de Carlos Botelho - PECB (ca. 37.000 ha) foi avaliada a composição, riqueza e distribuição geográfica das espécies vasculares nativas. A análise de 1143 espécies pertencentes a 140 famílias (sensu APG III) confirmaram o padrão encontrado para outras florestas do Leste do Brasil, com altas riquezas de Myrtaceae (85 espécies), Orchidaceae (81), Fabaceae (57), Asteraceae, Melastomataceae (54), Lauraceae (53), Rubiaceae (51), Bromeliaceae (43), Piperaceae (30) e Solanaceae (25), além de pteridófitas (123). Os gêneros mais ricos do Parque foram: Eugenia (34), Ocotea (26), Leandra, Myrcia, Vriesea (18), Piper (16), Solanum (15), Miconia (14), Mollinedia (13) e Peperomia (12). Houve grande variação na riqueza e composição de espécies entre hábitos, bem como no número de famílias representadas nos hábitos considerados (apenas Rubiaceae teve espécies em todos os hábitos, exceto parasitas). As árvores obtiveram a maior contribuição na riqueza total (39,1%), valor que representou mais de 20% das espécies de árvores citadas para toda a Floresta Atlântica do Sudeste do Brasil. Em seguida, foram os epífitos (22,4%), ervas (18,4%), arbustos (10,1%), lianas (9,1%) e parasitas (0,9%). De maneira geral, a riqueza e a composição por hábitos foram bastante similares ao encontrado nas demais florestas neotropicais (e.g. alta contribuição de pteridófitas ente os epífitos), apesar de alguns dos hábitos permanecerem subamostrados no PECB (principalmente ervas, lianas e epífitos). A ocorrência de espécies endêmicas da Floresta Atlântica foi elevada (65%), com predominância de espécies de ocorrência no Sul da Floresta Atlântica (43%). Espécies pantropicais foram raras (2%), sendo mais comuns entre as pteridófitas e entre as herbáceas. Myrtaceae e Melastomataceae foram as famílias com maior número e proporção de espécies endêmicas.

In the Montane and Submontane Rain Forest of the Carlos Botelho State Park - PECB (ca. 37,000 ha) the composition, richness and geographical distribution of native, vascular forest species was evaluated. The analysis of 1143 species of 140 families supported the pattern found for other forests of Eastern Brazil, showing high species richness of Myrtaceae (85 species), Orchidaceae (81), Fabaceae (57), Asteraceae, Melastomataceae (54), Lauraceae (53), Rubiaceae (51), Bromeliaceae (43), Piperaceae (30) and Solanaceae (25), besides ferns (123). The most species-rich genera were Eugenia (34), Ocotea (26), Leandra, Myrcia, Vriesea (18), Piper, Solanum (16), Miconia (14), Mollinedia (13), and Peperomia (12). The richness and composition varied greatly among life forms, as well as the number of families represented in each one of them (only Rubiaceae had species in all life forms, except parasites). Trees had the largest contribution of total richness (39.1%), a value that represented more than 20% of the species listed for the whole Atlantic Forest of Southeastern Brazil. Trees were followed by epiphytes (22.4%), herbs (18.4%), shrubs (10.1%), lianas (9.1%), and parasites (0.9%). The overall richness and composition of life forms was quite close to other neotropical forests (e.g. high contribution of ferns among epiphytes), although some life forms remain undersampled in the PECB (mainly herbs, lianas and epiphytes). The occurrence of species endemic to the Atlantic Forest was pronounced (65%), with a predominance of species restricted to the Southern Atlantic Forest (43%). Pantropical species were rare (2%), being more common among ferns. Myrtaceae and Melastomataceae were the families with greater number and proportion of endemic species.

Localizado na Serra de Paranapiacaba, sul do Estado de São Paulo, o Parque Estadual Carlos Botelho (PECB) abriga mais de 37.000 ha de Floresta Atlântica em um dos remanescentes mais importantes e extensos deste Bioma no Brasil. No Parque, predomina a Floresta Ombrófila Densa Montana e Submontana. Com o objetivo de organizar as informações florísticas disponíveis e direcionar futuros levantamentos, este estudo apresenta a lista de espécies vasculares nativas das florestas do PECB. Além de coletas pessoais dos autores, foram compilados mais de 3.900 registros citados desde 1967. Provindos de diferentes fontes de informação, estes registros foram checados para verificar a presença de sinonímias botânicas e novas combinações. Foi listado um total de 1.143 espécies vasculares pertencentes a 140 famílias e 528 gêneros (outras 63 espécies não foram incluídas por serem exóticas ou de ocorrência/identificação duvidosa). Houve grande riqueza de Myrtaceae, Orchidaceae, Fabaceae, Asteraceae, Melastomataceae, Lauraceae, Rubiaceae e Bromeliaceae. Apesar da alta riqueza de espécies, a riqueza de ervas, epífitos e lianas está certamente subestimada no Parque, de modo que futuros levantamentos certamente incluirão várias espécies na lista apresentada aqui. Adicionalmente, foram encontradas mais de 60 espécies com algum grau de ameaça de extinção, principalmente entre as famílias Myrtaceae, Lauraceae e Gesneriaceae. Assim, os resultados encontrados colocam o PECB entre as unidades de conservação com maior riqueza de espécies no Estado de São Paulo, com grande importância nacional para a conservação de espécies de plantas.

Located in the Serra de Paranapiacaba, South of São Paulo State, the Carlos Botelho State Park (PECB) shelters more than 37,000 ha of Atlantic Forest in one of the most important and large remnants of this Biome in Brazil. In the Park the Montane and Submontane rain forests are the predominant types of forests. Aiming to organize the available floristic information and to orient future surveys, this study presents the list of native vascular species of the PECB forests. Besides authors´ personal collections, more than 3,900 records since 1967 were compiled. Coming from different sources of information, these records were checked for the presence of botanical synonyms and new combinations. A total of 1,143 species belonging to 528 genera and 140 families were listed (other 63 species were not included because they were non-native or of doubtful occurrence/determination). There was a great richness of Myrtaceae, Orchidaceae, Fabaceae, Asteraceae, Melastomataceae, Lauraceae, Rubiaceae and Bromeliaceae. Although high species richness was found, the richness of herbs, lianas and epiphytes are certainly underestimated and future surveys will add many species to the list presented here. In addition, more than 60 endangered species were found, mainly among the Myrtaceae, Lauraceae and Gesneriaceae families. Therefore, these results put the PECB among the most species-rich conservation units of São Paulo state with great relevance to national conservancy of plant diversity.

Nós investigamos a estrutura, diversidade e distribuição de espécies arbóreas em uma parcela de 10,24 ha de uma floresta alta de Restinga (FAR) no Sudeste do Brasil. Nós amostramos 15.040 indivíduos pertencentes a 45 famílias, 87 gêneros e 116 espécies (densidade= 1.468 árvores ha-1, e área basal= 28,0 m² ha-1). A riqueza média foi menor que outros tipos de florestas tropicais e outras FAR amostradas em menor intensidade, provavelmente pela juventude e hidromorfia dos solos na área de estudo. A densidade, área basal, composição e diversidade arbórea variaram consideravelmente de acordo com a classe de tamanho considerada. A parcela estudada teve uma densidade similar a outras florestas tropicais, mas com menor área basal (menos indivíduos > 60 cm de diâmetro) e maior densidade de árvores pequenas. Fustes múltiplos não foram frequentes (11% dos indivíduos), mas foram comuns entre as espécies (74% das espécies). A distribuição espacial foi predominantemente agregada, um padrão comum a outros tipos de florestas tropicais. Além do substrato arenoso, a parcela estudada e outras florestas de areia branca do mundo tiveram padrões muito similares de estrutura, riqueza e diversidade. Assim, consideramos a FAR como um subtipo evidente de floresta de areia branca.

We assessed the structure, diversity and distribution of tree species in a 10.24-ha permanent plot of high Restinga forest (HRF) in southeastern Brazil. We sampled 15,040 individuals belonging to 45 families, 87 genera and 116 species (density= 1,468 trees ha-1, and basal area= 28.0 m² ha-1). Mean richness was lower than other types of tropical forests and other HRFs that have been less intensively sampled, which is probably due to the younger age and hydromorphy of the soils in the study site. Tree density, basal area, species composition, and diversity all varied considerably depending on the size class considered. The studied plot had a density similar to other tropical forests but with a smaller basal area (fewer individuals > 60 cm in diameter), and higher density of smaller trees. Multi-stemmed individuals were not frequent (11% of the trees), though they were widespread among species (74% of the species). Spatial distribution was predominantly clumped, a pattern common to other types of tropical forests. Besides growing over white-sand soils, the PEIC plot and other white-sand forests of the world also had very similar patterns of community structure, richness and diversity. Therefore, we consider the HRF as a recognizable subtype of white-sand forest.

Este estudo visa investigar o consenso entre informantes no reconhecimento e denominação de espécies arbóreas de um ambiente com alta diversidade, a floresta atlântica brasileira (Sete Barras, SP), através de um procedimento metodológico baseado em estímulos padronizados. Foram selecionados sete especialistas locais conhecedores de espécies arbóreas usadas para madeira e artesanatos, que percorreram individualmente uma mesma área de 1,72 ha para identificar e nomear todas as árvores conhecidas com mais de 4 cm de DAP (diâmetro na altura do peito) através de nomes populares. Todas as árvores foram identificadas botanicamente e tiveram seus DAP e altura determinados. A saliência ecológica das espécies arbóreas, expressa em termos da abundância, da altura média e do DAP, foi testada com relação ao conhecimento de cada informante em nomear as espécies. As caminhadas guiadas resultaram em 708 eventos de identificação, com nomes populares que correspondem a 122 espécies botânicas, ou a 68% de todas as espécies arbóreas presentes. Tanto a reduzida abundância como a saliência ecológica de espécies raras podem explicar seu reconhecimento. As concordâncias mais elevadas em nomear uma árvore foram relacionadas somente à abundância da espécie e não ao seu tamanho (dado pelo diâmetro e pela altura). Em alguns casos, não há um único nome popular para uma espécie botânica, refletindo a variação intrínseca no conhecimento local, que deve ser considerada em estudos etnobotânicos, nas avaliações ecológicas baseadas no conhecimento local, assim como em programas de manejo e conservação participativos.

This study aims to investigate the consensus among informants in the naming of tree species from a high diversity environment, the Brazilian Atlantic Forest (Sete Barras, SP), through a methodological procedure based on standardized stimuli. Seven selected local experts on tree species used for timber and handicrafts were asked to walk individually across the same area of 1.72 ha and identify and name all the known trees of more than 4 cm DBH (diameter at breast height) using common names. All trees were botanically identified, and their DBH and height were measured. The ecologic salience of tree species, expressed in terms of abundance, average height and DBH, was tested in relation to the informants' knowledge and species naming. The guided walks resulted on 708 identification events, with common names corresponding to 122 botanical species, or 68% of all tree species present. Both the reduced abundance and ecological salience of rare species can explain their recognition. The highest concordances in naming a tree were related only to the species abundance and not to their size (given by diameter and height). In some cases, there is no single common name for a botanical species, reflecting the intrinsic variation in local knowledge, which must be considered in ethnobotanical studies, in ecological assessments based on local knowledge, as well as in community-based conservation and management programs.

Neste estudo, nós descrevemos e analisamos o uso de recursos vegetais em uma região próxima a uma área de conservação. Os dados foram coletados através de entrevistas semi-estruturadas, incluindo listagens livres dos recursos vegetais conhecidos. As espécies foram identificadas através de coletas botânicas e de observações de campo. Foram entrevistados 58 habitantes; cultivo de banana, trabalho em fazendas de gado e extração de palmito são suas atividades econômicas principais. Foram mencionadas 248 etnoespécies, correspondendo a mais de 200 espécies botânicas. As plantas foram agrupadas em quatro habitats (A = floresta bem preservada; B = floresta perturbada, em estágios successionais avançados; C = ambientes recentemente perturbados; D = áreas cultivadas e quintais). Uma maior diversidade foi encontrada para o habitat A, seguido por C+D, e finalmente por áreas B; entretanto, é esperada uma riqueza maior de espécies para a área B quando comparada a C+D. Há poucas espécies comuns, e proporções comparáveis de espécies intermediárias e raras, para todos os habitats. As espécies comuns ocorrem em todos os tipos de habitats. O conhecimento local das plantas dos habitats bem preservados é mais diverso do que para plantas de outras áreas, sugerindo que a relação entre habitantes e a área de conservação é ainda intensa.

In this article we describe and analyze the use of plant resources in a region nearby a conservation area. Data were collected through semi-structured interviews, in which we asked the interviewees to free list the plants known. Species cited were identified through collection of botanical samples, and field observations. Fifty-eight inhabitants were interviewed; banana farming, cattle ranching, and extracting palm hearts are their main economic activities. A total of 248 ethnospecies were mentioned, including over 200 botanical species. Plants were grouped into four habitats (A = well-preserved forest; B = disturbed forest in old successional stages; C = recently disturbed environments; D = cultivated areas and home gardens). Highest diversity is known for plants from A habitats, followed by C+D, and finally by B areas; however, a higher number of species is expected in B areas when compared to C+D. There is a small number of common species, and comparable proportions of intermediate and rare species, for all habitats. Common species occur in all types of habitats. Local knowledge of plants from well-preserved habitats is more diverse than for plants from other areas, suggesting that the relationship between inhabitants and the conservation area is still intense.

O número de variedades de tangerinas utilizadas economicamente é muito restrito, apesar da importância comercial deste grupo de citros. O Banco Ativo de Germoplasma de Citros do Centro de Citricultura Sylvio Moreira/IAC possui em torno de 383 acessos de tangerineiras e híbridos, os quais têm sido estudados sob o ponto de vista botânico, genético e agronômico. Este trabalho visa descrever por meio de 38 caracteres morfológicos, os frutos das tangerineiras Satsuma Unshiu Wase, Clementina, Mel, Portuguesa, Natsu Mikan, Dancy, Cascalho, Campeona, Mexerica-do-Pará e Mexerica-do-Rio. Foram coletados 30 frutos maduros de cada acesso, sendo 10 frutos por planta, num total de 3 plantas por acesso. As tangerineiras, enxertadas sobre tangerineira Cleópatra e espaçadas de 7,5 m entre linhas por 5,5 m entre plantas, foram estudadas com 8 anos de plantio (safra 1994). Foi observada variabilidade fenotípica acentuada entre os acessos estudados, para a maioria dos caracteres avaliados e verificou-se que muitos caracteres agronômicos desejáveis encontram-se dispersos entre os acessos analisados, podendo vir a ser aproveitados em programas de melhoramento. A análise de agrupamento dos acessos através dos caracteres avaliados quantitativamente pode fornecer indicativos sobre as distâncias filogenéticas entre os diferentes genótipos.

The number of mandarin varieties economically explored is very restricted, in spite of their commercial importance. The Active Citrus Germplasm Bank, of the `Centro de Citricultura Sylvio Moreira/IAC' holds around 383 accessions of mandarins and hybrids, which are analyzed in botanical, genetic and agronomic aspects. As a part of this program, this work aims the fruit morphological description through 38 characters of the following mandarins: Satsuma Unshiu Wase, Clementina, Mel, Portuguesa, Natsu Mikan, Dancy, Cascalho, Campeona, Mexerica-do-Pará and Mexerica-do-Rio. The mandarin trees are about 8 years old spaced 7.5 m between lines and 5.5 m between plants, and were grafted on Cleopatra. A large phenotypic variation in most of the analyzed characters was observed. The best characters, from the economic point of view, are dispersed through the analyzed accessions and can be further explored in genetic breeding programs. The cluster analysis carried out with characters measured quantitatively can be useful for the knowledge of the philogenetic distances among each accession.

No presente trabalho foram reconhecidas cinco variedades para Mecardonia procumbens (Mill.) Small (Scrophulariaceae), sendo que novas combinações são propostas. Além disso, três espécies anteriormente referidas para o Brasil foram incluídas na sinonímia destas variedades, o que faz com que no Brasil passe a ser considerada a existência de apenas quatro espécies de Mecardonia: M. pubescens Rossow, M. serpylloides (Cham. & Schltdl.) Pennell, M. grandiflora (Benth.) Pennell e M. procumbens (Mill.) Small. Neste trabalho são fornecidas chave de identificação para as variedades e lista com as sinonímias das mesmas.

Five varieties of Mecardonia procumbens (Mill.) Small (Scrophulariaceae) are recognized in this work and new combinations are proposed. In addition, three species which were reported to Brazil, are now included as a synonym of these varieties. So, in Brazil, four species of Mecardonia are recognized: M. pubescens Rossow, M. serpylloides (Cham. & Schltdl.) Pennell, M. grandiflora (Benth.) Pennell and M. procumbens (Mill.) Small. In this work a key for the varieties and a list of synonyms are provided.